Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRDCB7Z8K6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRDCB7Z8K6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms