Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4E171 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4E171 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4E171 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4E171 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4E171 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4E171 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4E171 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4E171 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4E171 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4E171 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B4E171 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4E171 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4E171 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4E171 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4E171 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4E171 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
B4E171 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
B4E171 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4E171 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
B4E171 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
B4E171 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
B4E171 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4E171 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4E171 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
B4E171 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4E171 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4E171 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4E171 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4E171 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4E171 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms