Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD3A2A2Y4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMD3A2A2Y4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD3A2A2Y4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms