Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SF3B4Q15427 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.443e-12■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.313e-12■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.163e-12■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 GSDMD-202ENST00000524846 3462 ntTSL 215.14■□□□□ 0.013e-12■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 GSDMD-215ENST00000534018 1101 ntTSL 515.09■□□□□ 0.013e-12■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 GSDMD-214ENST00000533888 576 ntTSL 414.26□□□□□ -0.133e-12■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 GSDMD-213ENST00000533348 724 ntTSL 513.83□□□□□ -0.23e-12■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.124e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.224e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.354e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.424e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.434e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.161e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.571e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.691e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 LRP1-212ENST00000556830 1847 ntTSL 212.81□□□□□ -0.366e-16■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.145e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 PCSK6-207ENST00000558951 543 ntTSL 38.62□□□□□ -1.035e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 PCSK6-211ENST00000559605 379 ntTSL 37.81□□□□□ -1.165e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 PHYKPL-203ENST00000393488 1001 ntTSL 311.79□□□□□ -0.524e-6■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 HMGCR-206ENST00000508070 450 ntTSL 37.27□□□□□ -1.251e-12■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.52e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 IRF9-215ENST00000561415 1769 ntTSL 217.31■□□□□ 0.364e-7■□□□□ 10.9
SF3B4Q15427 MYC-204ENST00000520751 577 ntTSL 317.2■□□□□ 0.342e-7■□□□□ 10.9
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