Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 ATP2B3-203ENST00000359149 4234 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RAG2P55895 VIT-204ENST00000401530 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RAG2P55895 RRM2-212ENST00000615152 3434 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RAG2P55895 DDR1-239ENST00000452441 3857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RAG2P55895 MYO1C-204ENST00000545534 3676 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RAG2P55895 ZNF655-204ENST00000394163 4528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RAG2P55895 GABRA5-201ENST00000335625 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RAG2P55895 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RAG2P55895 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 RAMP2-AS1-205ENST00000592670 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 DCLK1-201ENST00000255448 5703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AC100774.1-201ENST00000565581 1603 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AC020978.10-201ENST00000623181 2704 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 SDHD-201ENST00000375549 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AC131254.1-201ENST00000507496 1867 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 CCT6B-202ENST00000421975 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 FUT6-201ENST00000286955 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 GNL3L-201ENST00000336470 2357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 CASP7-212ENST00000621607 2378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 KNSTRN-216ENST00000608100 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AC004585.2-201ENST00000624090 1473 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 SIRPB2-201ENST00000359801 2642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 USO1-204ENST00000514213 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 IGLV3-21-201ENST00000390308 602 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AL663070.1-201ENST00000438210 725 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AC016924.1-201ENST00000511512 501 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 MEG3-223ENST00000524131 721 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 OVOL1-AS1-203ENST00000534178 493 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 KRT18P7-201ENST00000557241 1219 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AC010547.1-202ENST00000567341 230 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AC092301.1-201ENST00000601618 764 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 FXYD3-207ENST00000604255 780 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 LIN28B-AS1-204ENST00000636951 610 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 PHC1-201ENST00000433083 5033 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 MMP19-201ENST00000322569 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 ATP11AUN-201ENST00000623100 2241 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 SLC3A1-207ENST00000409741 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 TMEM33-202ENST00000325094 6221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 PPIP5K1-201ENST00000334933 5586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 PPIP5K1-203ENST00000360135 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 PPIP5K1-204ENST00000360301 5565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 PPIP5K1-206ENST00000381885 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 N6AMT1-201ENST00000303775 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 CAPN3-203ENST00000349748 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 NAP1L6-201ENST00000373518 2044 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 SSU72-202ENST00000359060 4176 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 POTEA-201ENST00000519951 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 GALNT15-201ENST00000339732 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 UBAP2-205ENST00000379239 2513 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 MIR100HG-212ENST00000531381 3370 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 Z93929.2-201ENST00000615011 2623 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 CALCR-201ENST00000359558 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RAG2P55895 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 HSD3B1-204ENST00000528909 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 EIF2AK2-203ENST00000395127 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 CCDC18-201ENST00000343253 4867 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 PIK3C2B-204ENST00000424712 7522 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 TIA1-205ENST00000433529 4647 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 M1AP-209ENST00000536235 2531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 LIPG-205ENST00000580036 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 NUTM1-204ENST00000614490 4196 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AC099792.1-202ENST00000635290 2012 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 PDYN-201ENST00000217305 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 ZNF438-204ENST00000413025 3106 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 INTS14-215ENST00000569491 1797 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 PLK4-211ENST00000515069 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 HHAT-206ENST00000537898 3446 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 CD22-203ENST00000419549 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 EXOSC9-202ENST00000379663 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 PGPEP1-202ENST00000269919 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 PDE6H-201ENST00000266395 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 TBC1D3P3-201ENST00000342824 1080 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 HIST1H1C-201ENST00000343677 642 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 PGAM1P4-201ENST00000397343 750 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RAG2P55895 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms