Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms