Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CFDP1Q9UEE9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms