Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L1Q9P0L9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD2L1Q9P0L9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms