Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMSN1Q9NSI8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAMSN1Q9NSI8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms