Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 CALM1-214ENST00000557020 557 ntTSL 419.66■□□□□ 0.741e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.171e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-216ENST00000514669 809 ntTSL 326.33■■□□□ 1.86e-10■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.53e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-220ENST00000480443 546 ntTSL 436.6■■■■□ 3.453e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-214ENST00000430645 598 ntTSL 435.77■■■■□ 3.323e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-216ENST00000441258 649 ntTSL 533.72■■■□□ 2.993e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.833e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.263e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.413e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 RASGRP2-202ENST00000377485 429 ntTSL 323.23■■□□□ 1.313e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)32.39■■■□□ 2.781e-6■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.099e-8■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 AC011476.3-201ENST00000593060 786 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.411e-10■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.921e-10■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 05e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)20.9■□□□□ 0.943e-7■■■■□ 24
DROSHAQ9NRR4 KMT5C-202ENST00000402499 888 ntTSL 235.72■■■■□ 3.311e-7■■■■□ 24
DROSHAQ9NRR4 KMT5C-210ENST00000589338 1601 ntTSL 1 (best)28.9■■■□□ 2.221e-7■■■■□ 24
DROSHAQ9NRR4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.223e-6■■■■□ 24
DROSHAQ9NRR4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.644e-6■■■■□ 24
DROSHAQ9NRR4 FGFR3-207ENST00000474521 545 ntTSL 227.09■■□□□ 1.932e-13■■■■□ 24
DROSHAQ9NRR4 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 523.67■■□□□ 1.382e-6■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 NOC4L-202ENST00000535343 669 ntTSL 325.03■■□□□ 1.63e-7■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 AKT1-204ENST00000544168 1564 ntTSL 225.69■■□□□ 1.73e-8■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 AKT1-210ENST00000554826 572 ntTSL 322.55■■□□□ 1.23e-8■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 519.96■□□□□ 0.793e-8■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 TMEM63A-201ENST00000366835 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.098e-7■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 HIVEP1-209ENST00000627968 8924 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-7■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.112e-7■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.112e-7■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 HIVEP1-206ENST00000487103 585 ntTSL 210.9□□□□□ -0.662e-7■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 HIVEP1-207ENST00000491710 579 ntTSL 34.24□□□□□ -1.732e-7■■■■□ 23.9
DROSHAQ9NRR4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.963e-27■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.923e-27■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 532.11■■■□□ 2.734e-7■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.494e-7■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.794e-7■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.054e-7■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.864e-7■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.496e-9■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-217ENST00000480524 2727 ntTSL 1 (best)17.68■□□□□ 0.426e-9■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-220ENST00000489483 5682 ntTSL 216.69■□□□□ 0.266e-9■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-215ENST00000466257 706 ntTSL 313.36□□□□□ -0.276e-9■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.094e-6■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 MXD4-204ENST00000513380 624 ntTSL 519.84■□□□□ 0.774e-6■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 CORO1C-215ENST00000551044 567 ntTSL 311.71□□□□□ -0.532e-7■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 322.92■■□□□ 1.261e-6■■■■□ 23.8
DROSHAQ9NRR4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.172e-12■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 324.9■■□□□ 1.581e-6■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 MIR647-201ENST00000384823 96 ntBASIC16.62■□□□□ 0.252e-12■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 SREBF1-216ENST00000490796 698 ntTSL 230.7■■■□□ 2.515e-15■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 SREBF1-207ENST00000447641 644 ntTSL 321.74■■□□□ 1.075e-15■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 SREBF1-223ENST00000584760 564 ntTSL 220.59■□□□□ 0.895e-15■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 CSNK1G2-204ENST00000589350 780 ntTSL 526.23■■□□□ 1.799e-7■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 CSNK1G2-210ENST00000614707 249 ntTSL 221.74■■□□□ 1.079e-7■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.145e-28■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.911e-7■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.623e-7■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.644e-7■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 14e-7■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC7.29□□□□□ -1.242e-7■■■■□ 23.7
DROSHAQ9NRR4 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.953e-7■■■■□ 23.6
DROSHAQ9NRR4 DUXAP9-205ENST00000619938 642 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.353e-7■■■■□ 23.6
DROSHAQ9NRR4 DUXAP9-203ENST00000610585 903 ntTSL 316.7■□□□□ 0.263e-7■■■■□ 23.6
DROSHAQ9NRR4 DUXAP9-207ENST00000621361 2397 ntTSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.983e-7■■■■□ 23.6
DROSHAQ9NRR4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.61e-6■■■■□ 23.6
DROSHAQ9NRR4 PISD-216ENST00000486675 837 ntTSL 321.4■■□□□ 1.022e-7■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 ANK1-207ENST00000518061 892 ntTSL 323.34■■□□□ 1.333e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 ANK1-214ENST00000524227 3825 ntTSL 1 (best)11.96□□□□□ -0.53e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 SHROOM1-204ENST00000440118 1080 ntTSL 230.46■■■□□ 2.474e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.584e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 D2HGDH-214ENST00000473126 1612 ntTSL 1 (best)37.51■■■■□ 3.592e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 D2HGDH-215ENST00000486953 2232 ntTSL 1 (best)33.57■■■□□ 2.962e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.962e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 D2HGDH-202ENST00000400769 2277 ntTSL 233.23■■■□□ 2.912e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.292e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 D2HGDH-206ENST00000436747 4549 ntTSL 1 (best)22.36■■□□□ 1.172e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.993e-27■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 INS-IGF2-201ENST00000356578 1706 ntTSL 526.85■■□□□ 1.893e-27■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.113e-27■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.912e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 242.75■■■■■ 4.431e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 330■■■□□ 2.391e-6■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 PRRC2A-204ENST00000462617 1015 ntTSL 524.84■■□□□ 1.575e-7■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.925e-7■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 PRRC2A-214ENST00000492691 1118 ntTSL 219.18■□□□□ 0.665e-7■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 PRRC2A-209ENST00000482441 719 ntTSL 218.03■□□□□ 0.485e-7■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.035e-7■■■■□ 23.5
DROSHAQ9NRR4 GRINA-203ENST00000525513 796 ntTSL 524.43■■□□□ 1.52e-33■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 GRINA-208ENST00000533044 564 ntTSL 314.52□□□□□ -0.082e-33■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.682e-8■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 LARP1-210ENST00000519931 569 ntTSL 411.26□□□□□ -0.618e-9■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 FAAP20-214ENST00000497675 4478 ntTSL 218.48■□□□□ 0.551e-7■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 GSTO1-204ENST00000445155 829 ntTSL 234.11■■■■□ 3.053e-30■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 GSTO1-203ENST00000432659 592 ntTSL 23.99□□□□□ -1.773e-30■■■■□ 23.4
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