Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TDRD3Q9H7E2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRD3Q9H7E2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms