Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NXF3Q9H4D5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms