Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM5Q9C035 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM5Q9C035 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms