Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HERPUD2Q9BSE4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERPUD2Q9BSE4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms