Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA3Q9BQP9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BPIFA3Q9BQP9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms