Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED2Q99967 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms