Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC41A2Q96JW4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms