Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf54Q8WWF1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf54Q8WWF1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf54Q8WWF1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
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