Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF680Q8NEM1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF680Q8NEM1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF680Q8NEM1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF680Q8NEM1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF680Q8NEM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF680Q8NEM1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF680Q8NEM1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF680Q8NEM1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF680Q8NEM1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF680Q8NEM1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF680Q8NEM1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms