Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSIP1Q8NA03 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FSIP1Q8NA03 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSIP1Q8NA03 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms