Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDCL2Q8N4E4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms