Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A9Q8IVB4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A9Q8IVB4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms