Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO3Q6UWJ1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO3Q6UWJ1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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