Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
REEP3Q6NUK4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
REEP3Q6NUK4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms