Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT80Q6KB66 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRT80Q6KB66 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms