Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN9Q5TKA1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIN9Q5TKA1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIN9Q5TKA1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIN9Q5TKA1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIN9Q5TKA1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIN9Q5TKA1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN9Q5TKA1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN9Q5TKA1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN9Q5TKA1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN9Q5TKA1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN9Q5TKA1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN9Q5TKA1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms