Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LINC01620Q4KN68 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01620Q4KN68 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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LINC01620Q4KN68 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LINC01620Q4KN68 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LINC01620Q4KN68 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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LINC01620Q4KN68 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01620Q4KN68 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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