Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP100Q494V2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP100Q494V2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms