Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms