Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSPP1Q1MSJ5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPP1Q1MSJ5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms