Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIX1Q15475 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIX1Q15475 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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