Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ELOBQ15370 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELOBQ15370 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms