Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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IRF4Q15306 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF4Q15306 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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IRF4Q15306 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF4Q15306 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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