Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SCARB2Q14108 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCARB2Q14108 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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