Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSAMPQ13449 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LSAMPQ13449 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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