Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGDRQ13258 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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