Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CBX3Q13185 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CBX3Q13185 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CBX3Q13185 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CBX3Q13185 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CBX3Q13185 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CBX3Q13185 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CBX3Q13185 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CBX3Q13185 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CBX3Q13185 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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CBX3Q13185 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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CBX3Q13185 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX3Q13185 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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