Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)9.42□□□□□ -0.98e-12■■■■■ 26.9
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TARDBPQ13148 DCP2-204ENST00000508359 838 ntTSL 27.18□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 26.9
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TARDBPQ13148 ANKHD1-209ENST00000431508 4079 ntTSL 26.98□□□□□ -1.293e-13■■■■■ 26.9
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TARDBPQ13148 POLG2-207ENST00000581355 652 ntTSL 36.1□□□□□ -1.439e-7■■■■■ 26.9
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TARDBPQ13148 AL109811.4-203ENST00000612542 554 ntAPPRIS P1 TSL 54.34□□□□□ -1.711e-13■■■■■ 26.9
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TARDBPQ13148 GTF2H3-208ENST00000539994 562 ntTSL 44.45□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 26.8
TARDBPQ13148 GTF2H3-209ENST00000542279 552 ntTSL 54.45□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 26.8
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TARDBPQ13148 ARMC6-217ENST00000541898 1198 ntTSL 219.35■□□□□ 0.697e-8■■■■□ 26.7
TARDBPQ13148 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.527e-8■■■■□ 26.7
TARDBPQ13148 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.487e-8■■■■□ 26.7
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