Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN3Q13064 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MKRN3Q13064 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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