Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN1Q04323 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN1Q04323 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms