Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLCB3Q01970 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLCB3Q01970 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLCB3Q01970 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLCB3Q01970 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLCB3Q01970 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLCB3Q01970 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLCB3Q01970 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLCB3Q01970 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLCB3Q01970 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLCB3Q01970 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLCB3Q01970 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms