Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNAQ00169 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITPNAQ00169 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms