Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNB1P98172 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms