Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPEP62304 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPEP62304 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms