Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP46P62068 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP46P62068 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP46P62068 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP46P62068 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP46P62068 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP46P62068 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP46P62068 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP46P62068 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP46P62068 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP46P62068 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP46P62068 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP46P62068 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP46P62068 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP46P62068 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP46P62068 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP46P62068 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP46P62068 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP46P62068 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP46P62068 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP46P62068 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP46P62068 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP46P62068 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP46P62068 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP46P62068 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP46P62068 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP46P62068 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP46P62068 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP46P62068 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP46P62068 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP46P62068 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP46P62068 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP46P62068 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP46P62068 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP46P62068 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP46P62068 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP46P62068 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP46P62068 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP46P62068 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP46P62068 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP46P62068 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms