Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP1B3P54709 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP1B3P54709 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms