Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV2P52735 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV2P52735 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV2P52735 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV2P52735 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV2P52735 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV2P52735 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV2P52735 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV2P52735 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAV2P52735 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAV2P52735 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAV2P52735 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAV2P52735 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAV2P52735 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAV2P52735 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV2P52735 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV2P52735 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV2P52735 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV2P52735 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV2P52735 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV2P52735 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV2P52735 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV2P52735 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV2P52735 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV2P52735 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV2P52735 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV2P52735 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAV2P52735 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAV2P52735 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAV2P52735 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAV2P52735 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV2P52735 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV2P52735 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV2P52735 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV2P52735 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV2P52735 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV2P52735 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV2P52735 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV2P52735 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV2P52735 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV2P52735 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV2P52735 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV2P52735 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms