Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNA2P51530 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNA2P51530 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNA2P51530 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNA2P51530 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNA2P51530 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNA2P51530 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNA2P51530 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNA2P51530 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNA2P51530 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNA2P51530 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNA2P51530 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNA2P51530 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNA2P51530 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNA2P51530 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNA2P51530 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DNA2P51530 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNA2P51530 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNA2P51530 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNA2P51530 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNA2P51530 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNA2P51530 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNA2P51530 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNA2P51530 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNA2P51530 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNA2P51530 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNA2P51530 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNA2P51530 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms