Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 ZC3H7A-201ENST00000355758 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.664e-6■■■■□ 24
AARSP49588 CEP57-201ENST00000325486 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.664e-6■■■■□ 24
AARSP49588 PHF3-201ENST00000262043 8233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.674e-6■■■■□ 24
AARSP49588 DNM1L-211ENST00000547312 2393 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SRGAP2C-202ENST00000367123 7204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.694e-6■■■■□ 24
AARSP49588 DNM1L-208ENST00000546649 2097 ntTSL 210.69□□□□□ -0.74e-6■■■■□ 24
AARSP49588 GGA2-210ENST00000567339 293 ntTSL 310.66□□□□□ -0.74e-6■■■■□ 24
AARSP49588 YME1L1-209ENST00000613434 4127 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.714e-6■■■■□ 24
AARSP49588 TAF8-201ENST00000372977 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.714e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ZC3H7A-207ENST00000571676 859 ntTSL 210.56□□□□□ -0.724e-6■■■■□ 24
AARSP49588 GGA2-214ENST00000569182 587 ntTSL 410.56□□□□□ -0.724e-11■■■■□ 24
AARSP49588 YME1L1-203ENST00000376016 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.744e-6■■■■□ 24
AARSP49588 CEP57-202ENST00000325542 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.744e-6■■■■□ 24
AARSP49588 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.764e-6■■■■□ 24
AARSP49588 PHF3-208ENST00000506783 3700 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.764e-6■■■■□ 24
AARSP49588 TAF8-205ENST00000465926 1222 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.774e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SH2D3A-203ENST00000595369 3493 ntTSL 210.06□□□□□ -0.89e-7■■■■□ 24
AARSP49588 ANKLE2-205ENST00000538591 886 ntTSL 39.41□□□□□ -0.94e-6■■■■□ 24
AARSP49588 YME1L1-206ENST00000463270 745 ntTSL 39.36□□□□□ -0.914e-6■■■■□ 24
AARSP49588 DNM1L-206ENST00000434676 1008 ntTSL 29.26□□□□□ -0.934e-6■■■■□ 24
AARSP49588 DNM1L-204ENST00000413295 1064 ntTSL 29.18□□□□□ -0.944e-6■■■■□ 24
AARSP49588 CBL-202ENST00000634301 340 ntTSL 39.1□□□□□ -0.954e-6■■■■□ 24
AARSP49588 GLB1-216ENST00000485698 550 ntTSL 48.78□□□□□ -14e-6■■■■□ 24
AARSP49588 GLB1-215ENST00000482097 547 ntTSL 58.78□□□□□ -14e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ATXN7L3-212ENST00000593073 527 ntTSL 48.72□□□□□ -1.014e-6■■■■□ 24
AARSP49588 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.014e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ANKLE2-211ENST00000545623 1288 ntTSL 38.63□□□□□ -1.034e-6■■■■□ 24
AARSP49588 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.044e-6■■■■□ 24
AARSP49588 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.14e-6■■■■□ 24
AARSP49588 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.124e-6■■■■□ 24
AARSP49588 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.164e-6■■■■□ 24
AARSP49588 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.194e-6■■■■□ 24
AARSP49588 DNM1L-209ENST00000546757 2661 ntTSL 57.52□□□□□ -1.214e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ANKLE2-204ENST00000535036 741 ntTSL 57.38□□□□□ -1.234e-6■■■■□ 24
AARSP49588 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.274e-6■■■■□ 24
AARSP49588 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.294e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SKP1-213ENST00000524288 732 ntTSL 1 (best)6.66□□□□□ -1.344e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.374e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ZCCHC7-206ENST00000488607 884 ntTSL 26.35□□□□□ -1.394e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ZC3H7A-215ENST00000576009 986 ntTSL 36.27□□□□□ -1.414e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.424e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.444e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ZCCHC7-204ENST00000463625 732 ntTSL 25.9□□□□□ -1.464e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.484e-6■■■■□ 24
AARSP49588 RAPGEF2-206ENST00000505478 838 ntTSL 55.66□□□□□ -1.54e-6■■■■□ 24
AARSP49588 CEP57-203ENST00000535224 760 ntTSL 35.57□□□□□ -1.524e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.534e-6■■■■□ 24
AARSP49588 LRP8-212ENST00000529670 660 ntTSL 55.37□□□□□ -1.554e-6■■■■□ 24
AARSP49588 PHF3-210ENST00000509876 7124 ntTSL 1 (best)5.28□□□□□ -1.564e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SELENOI-202ENST00000442141 504 ntTSL 55.03□□□□□ -1.64e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.624e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.624e-6■■■■□ 24
AARSP49588 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.664e-6■■■■□ 24
AARSP49588 CD55-208ENST00000476590 2163 ntTSL 1 (best)4.62□□□□□ -1.674e-6■■■■□ 24
AARSP49588 CEP57-206ENST00000537093 404 ntTSL 54.59□□□□□ -1.674e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SKP1-207ENST00000520417 610 ntTSL 34.53□□□□□ -1.684e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SKP1-212ENST00000523966 899 ntTSL 34.49□□□□□ -1.694e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SKP1-201ENST00000328392 572 ntTSL 54.47□□□□□ -1.694e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.74e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.74e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ARIH1-209ENST00000567762 319 ntTSL 34.35□□□□□ -1.714e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SKP1-205ENST00000519054 654 ntTSL 34.05□□□□□ -1.764e-6■■■■□ 24
AARSP49588 BRWD1-206ENST00000424441 1356 ntTSL 1 (best)3.8□□□□□ -1.84e-6■■■■□ 24
AARSP49588 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.854e-6■■■■□ 24
AARSP49588 BRWD1-210ENST00000446924 4990 ntTSL 23.49□□□□□ -1.854e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.864e-6■■■■□ 24
AARSP49588 CD55-207ENST00000465534 1480 ntTSL 1 (best)3.05□□□□□ -1.924e-6■■■■□ 24
AARSP49588 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.994e-6■■■■□ 24
AARSP49588 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.034e-6■■■■□ 24
AARSP49588 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.3□□□□□ -2.044e-6■■■■□ 24
AARSP49588 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.894e-6■■■■□ 24
AARSP49588 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.464e-6■■■■□ 24
AARSP49588 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.434e-6■■■■□ 24
AARSP49588 LIG1-206ENST00000594067 2697 ntTSL 218.39■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 24
AARSP49588 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 24
AARSP49588 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-8■■■■□ 24
AARSP49588 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 24
AARSP49588 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 24
AARSP49588 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 24
AARSP49588 LIG1-207ENST00000594759 4102 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 24
AARSP49588 LIG1-220ENST00000601091 3957 ntTSL 511.13□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 24
AARSP49588 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.93■□□□□ 0.942e-6■■■■□ 23.9
AARSP49588 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 23.9
AARSP49588 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.562e-6■■■■□ 23.9
AARSP49588 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 23.9
AARSP49588 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 23.9
AARSP49588 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 516.68■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 23.9
AARSP49588 KEL-208ENST00000479768 1856 ntTSL 514.79□□□□□ -0.045e-7■■■■□ 23.7
AARSP49588 KEL-201ENST00000355265 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.775e-7■■■■□ 23.7
AARSP49588 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 319■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 23.7
AARSP49588 ZCCHC7-203ENST00000461038 2793 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 23.6
AARSP49588 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 23.6
AARSP49588 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.692e-6■■■■□ 23.6
AARSP49588 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.55e-6■■■■□ 23.6
AARSP49588 GSE1-215ENST00000635906 666 ntTSL 313.02□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 23.5
AARSP49588 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 221.46■■□□□ 1.032e-6■■■■□ 23.5
AARSP49588 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 23.5
AARSP49588 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 23.5
AARSP49588 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 23.5
AARSP49588 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 28.37□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 23.5
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 71.8 ms