Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CAPZBP47756 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZBP47756 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms